​La caja Raspberry Pi Zero ha sido diseñada para adaptarse tanto a la Pi Zero como a la Pi Zero W y Pi Zero 2W. La carcasa consta de dos partes. Tiene una base estándar con un recorte para permitir el acceso al GPIO, y una selección de tres tapas: una tapa simple, una tapa GPIO (que permite el acceso al GPIO desde arriba) y una tapa de la cámara (que, cuando se usa) con el cable corto de la cámara suministrado, permite que la cámara Raspberry Pi o Camera Noir se coloquen perfectamente en su interior).